RNDr. Jan Mareš, Ph.D.
Funkce: Vědecký pracovník - Oddělení mikrobiální ekologie vody
Telefon:
387775886
E-mail:
jan.mares@centrum.cz
Místnost:
032
Dlouhodobě se zabývám problematikou diverzity, rozšíření, ekologie a taxonomie sinic. Zejména se specializuji na objasnění molekulární fylogeneze a evoluce sinic, analýzu jejich genomů a genetického potenciálu pro syntézu toxinů a jiných biologicky aktivních látek. Kromě základního výzkumu se podílím též na výzkumu s potenciálem pro využití v praxi hydrobiologického monitoringu (identifikace druhů sinic, ekotoxikologický monitoring), a dále na charakterizaci nových přírodních produktů izolovaných ze sinic, potenciálně využitelných např. ve farmacii a zemědělství (antibiotika, fungicidy).
NAROZEN: 27. ledna 1984, Hradec Králové
VZDĚLÁNÍ:
• 2009–2015: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
Doktorský studijní program Botanika, specializace Fykologie
Disertační práce: Polyfázický přístup k taxonomii vybraných zástupců sinic.
ODBORNÉ ZÁJMY
Evoluce, taxonomie a rozšíření sinic (řas), molekulární fylogenetika, genomika a bioinformatika.
VĚDEČTÍ ZAMĚSTNAVATELÉ
• Biologické centrum AVČR, v.v.i., Hydrobiologický ústav (od r. 2014)
• Botanický ústav AVČR, v.v.i. (2011-2017)
• Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta (2010, od r. 2012)
• IMikrobiologický ústav AVČR, v.v.i. (od r. 2013)
OSTATNÍ ZAMĚSTNÁNÍ
• Povodí Vltavy, s.p. - hydrobiolog (2008 – 2012)
GRANTY
• 2022-2024 GA ČR 22-05478S: „Monopolizace příjmu železa nebo služba společenstvu? Dvě tváře sinicových betahydroxyaspartátových sideroforů“, spoluřešitel
• 2022-2024 GA ČR 22-06374S: „Sjednocení systematiky sinic pomocí harmonizace polyfázické a genomové taxonomie“, hlavní řešitel
• 2019-2021 GA ČR 19-21649J: „Lov na zabijáka orlů - výzkum cyanotoxinu způsobujícího ptačí vakuolární myelinopatii“, hlavní řešitel
• 2014-2016 GA ČR 16-09381S: „Bioactive cyanobacterial lipopeptides: genome mining, detection, and structure-activity relationships“, spoluřešitel
• 2014-2016 GA ČR 14-18067S „Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria“, člen týmu
• 2012-2014 MŠMT AMVIS/KONTAKT II LH12100 „ Diversity of cyanobacteria from tropical and subtropical biomas“, člen týmu
• 2012- 2014 GA ČR P506/12/1818 „Phylogenetic and phenotypic evaluation of heterocytous cyanobacteria from the family Scytonemataceae”, člen týmu
• 2011 doctoral grant of the Institute of Physical Biology (Univ. South Bohemia) "Multilocus sequence analysis as a tool for robust phylogeny in heterocytous cyanobacteria", řešitel
• 2010 GA ČR 206/08/0318 „Phylogenetic relations, diversity and ecology of heterocytous cyanobacteria with polarised thalus”, člen týmu
Fykologické determinační praktikum (KBO/128 a KBO/129)
Jihočeská univerzita v Č. Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
Popis:
Kurzy KBO/128 a KBO/129 jsou plánovány jako blokové, s 5ti denním pobytem v zajímavé algologické lokalitě. Poslední den pobytu je koncipován jako shrnující přednáška základních typů řas a sinic, které se na lokalitě vyskytovaly. Obsahem cvičení je determinace sinic a řas ve vzorcích z různých biotopů (toky a stojaté vody různých typů, aerofytická stanoviště), které student sám získá. Cílem je podstatně rozšířit determinační schopnosti studentů při práci se vzorky řas a sinic z nejrůznějších typů biotopů.
EN: Bloc courses of 5-day stay in an interesting algological site with determination of algal and cyanobacterial species.
| Celkem nalezeno: 51 záznamů
|
|---|
|
Bohunická M. , Johansen J., Villanueva C.D., Mareš J.,
Štenclová L., Becerra–Absalón I., Hauer T., Kaštovský J. (2024) Revision of the pantropical genus Brasilonema (Nostocales, Cyanobacteria), with the description of 24 species new to science. Fottea
24
: 137–184. DOI: 10.5507/fot.2024.002 |
|
Masuda T., Mareš J., Shiozaki T., Inomura K., Fujiwara A., Prášil O. (2024) Crocosphaera watsonii – A widespread nitrogen-fixing unicellular marine cyanobacterium. Journal of Phycology
60
: 604–620. DOI: 10.1111/jpy.13450 |
|
Němečková K., Mareš J., Košek F., Culka A., Dudák J., Tymlová V., Žemlička J., Jehlička J. (2024) Comparative analysis of cyanobacterial communities in gypsum outcrops: insights from sites in Israel and Poland. Extremophiles
28
: 37. DOI: 10.1007/s00792-024-01352-4 |
|
Skotnicová P., Srivastava A., Aggarwal D., Talbot J., Karlínová I., Moos M., Mareš J., Bučinská L., Koník P., Šimek P., Tichý M., Sobotka R. (2024) A thylakoid biogenesis BtpA protein is required for the initial step of tetrapyrrole biosynthesis in cyanobacteria. New Phytologist
241
: 1236–1249. DOI: 10.1111/nph.19397 |
|
Bešta T., Mareš J.,
Čapková K., Janeček E.,
Štenclová L.,
Kust A.,
Říha M.,
Konopáčová E.,
Řeháková K. (2023) Littoral periphyton dynamics in newly established post‑mining lakes. Aquatic Sciences
85
: 21 . DOI: 10.1007/s00027-022-00914-y |
|
Jehlička J., Culka A., Němečková K., Mareš J. (2023) Using Raman spectroscopy to detect scytonemin of epiliths and endoliths from marble, serpentinite and gypsum. Journal of Raman Spectroscopy
54
: 1280–1296. DOI: 10.1002/jrs.6514 |
|
Masuda T., Inomura K., Mareš J., Kodama T., Shiozaki T., Matsui T., Suzuki K., Takeda S., Deutsch C., Prášil O., Furuya K. (2023) Coexistence of dominant marine phytoplankton sustained by nutrient specialization. Microbiology Spectrum
11
: 1-14. DOI: 10.1128/spectrum.04000-22 |
|
Němečková K., Mareš J., Procházková L., Culka A., Košek F., Wierzchos J., Nedbalová L., Dudák J., Tymlová V., Žemlička J., Kust A., Zima J., Nováková E., Jehlička J. (2023) Gypsum endolithic phototrophs under moderate climate (Southern Sicily): their diversity and pigment composition. Frontiers in Microbiology
14
: 1175066. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1175066 |
|
Schwark M.,
Martinez Yerena J., Röhrborn K., Hrouzek P., Divoká P.,
Štenclová L., Delawská K., Enke H., Vorreiter C., Wiley F., Sippl W., Sobotka R., Saha S., Wilde S.B., Mareš J., Niedermeyer T.H.J. (2023) More than just an eagle killer: The freshwater cyanobacterium Aetokthonos hydrillicola produces highly toxic dolastatin derivatives. PNAS
120
: e2219230120. DOI: 10.1073/pnas.2219230120 |
|
Štenclová L., Wilde S.B., Schwark M., Cullen J.L., McWhorter S.A., Niedermeyer T.H.J., Henderson W.M., Mareš J. (2023) Occurrence of aetokthonotoxin producer in natural samples – A PCR protocol for easy detection. Harmful Algae
125
: 102425. DOI: 10.1016/j.hal.2023.102425 |
|
Strunecký O., Ivanova A.P., Mareš J. (2023) An updated classification of cyanobacterial orders and families based on phylogenomic and polyphasic analysis. Journal of Phycology
59
: 12-51. DOI: 10.1111/jpy.13304 |
|
Sukačová K., Szotkowski M., Pařil P., Mareš J., Touš M., Vícha D., Polášek M., Márová I., Zavřel T. (2023) Simultaneous production of γ-linolenic acid and carotenoids by a novel microalgal strain isolated from the underexplored habitat of intermittent streams. Algal Research
71
: 103055. DOI: 10.1016/j.algal.2023.103055 |
|
Vondrák J., Svoboda S., Zíbarová L.,
Štenclová L., Mareš J., Pouska V., Košnar J., Kubásek J. (2023) Alcobiosis, an algal‑fungal association on the threshold of lichenisation. Scientific Reports
13
: 2957. DOI: 10.1038/s41598-023-29384-4 |
|
Čapková K.,
Bešta T., Mareš J., Čapek P.,
Řeháková K. (2022) A low-cost method of measuring the in situ primary productivity of periphyton communities of lentic waters. JoVE Journal of Visualized Experiments
190
: e64078. DOI: 10.3791/64078 |
|
Masuda T., Inomura K., Mareš J., Prášil O. (2022) Crocosphaera watsonii. Trends in Microbiology
30
: 805-806. DOI: 10.1016/j.tim.2022.02.006 |
|
Oren A., Mareš J., Rippka R. (2022) Validation of the names Cyanobacterium and Cyanobacterium stanieri, and proposal of Cyanobacteriota phyl. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
72
: 005528. DOI: 10.1099/ijsem.0.005528 |
|
Breinlinger S., Phillips T.J., Haram B.N., Mareš J.,
Martinez Yerena J., Hrouzek P., Sobotka R., Henderson W.M., Schmieder P., Williams S.M., Lauderdale J.D., Wilde H.D., Gerrin W.,
Kust A., Washington J.W., Wagner C., Geier B., Liebeke M., Enke H., Niedermeyer T.H.J., Wilde S.B. (2021) Hunting the eagle killer: A cyanobacterial neurotoxin causes vacuolar myelinopathy. Science
371
: 1335. DOI: 10.1126/science.aax9050 |
|
Chen G.E., Hitchcock A., Mareš J., Gong Y., Tichý M., Pilný J., Kovářová L., Zdvihalová B., Xu J., Hunter C., Sobotka R. (2021) Evolution of Ycf54-independent chlorophyll biosynthesis in cyanobacteria. PNAS
118
: e2024633118. DOI: doi.org/10.1073/pnas.2024633118 |
|
Galica T., Borbone N., Mareš J.,
Kust A., Caso A., Esposito G., Saurav K., Hájek J.,
Řeháková K., Urajová P., Costantino V., Hrouzek P. (2021) Cyanochelins, an overlooked class of widely distributed cyanobacterial siderophores, discovered by silent gene cluster awakening. Applied and Environmental Microbiology
87
: e03128-20. DOI: 10.1128/AEM.03128-20 |
|
Hauerová R., Hauer T., Kaštovský J., Komárek J., Lepšová-Skácelová O., Mareš J. (2021) Tenebriella gen. nov. – The dark twin of Oscillatoria Molecular Phylogenetics and Evolution
165
: Article number 107293. DOI: 10.1016/j.ympev.2021.107293 |
