RNDr. Jiří Nedoma, CSc.
Funkce: Vědecký pracovník - Oddělení mikrobiální ekologie vody
Telefon:
420387775875
E-mail:
nedoma@hbu.cas.cz
Web:
sites.google.com/site/jirned
Místnost:
39
Odborné zájmy:
Limnologie a mikrobiální ekologie údolních nádrží.
Primární prodkce: inkorporace 14C-bikarbonátu, velikostní frakcionace, extracelulární produkce organického uhlíku fytoplanktonem.
Bakteriální produkce a aktivita: inkorporace značených substrátů (thymidin, leucin).
Dynamika rozpuštěného fosforu a P-limitace: příjem a obrat 33P-značeného ortofosforečnanu.
Extracelulární enzymy: (zejména fosfatázy) aktivita, lokalizace a kvantifikace aktivity na úrovni jednotlivých buněk pomocí substrátů MUF, ELF97.
Analýza obrazu - aplikace v limnologii: měření velikosti bakteriálních buněk, kvantifikace vláknitých mikroorganismů, kvantifikace fluorescence na úrovni jednotlivých mikrobiálních buněk.
Analýza časových řad.
Rok narození: 1955
Vdělání a praxe:
1979 - absolvent Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze (obor biologie, specializace ekologická fyziologie živočichů).
1982 - RNDr.
1992 - CSc.
1979–1985 Fyziologický ústav ČSAV v Praze (studijní pobyt, interní aspirantura)
1986–1990 Ústav krajinné ekologie ČSAV v Českých Budějovicích (odborný pracovník)
1990–2005 Hydrobiologický ústav AV ČR v Českých Budějovicích (odborný, vědecký pracovník)
od 2006 – Biologické centrum Akademie věd České republiky, České Budějovice, Hydrobiologický ústav (vědecký pracovník)
Mezinárodní zkušenosti:
Institute of Freshwater and Fish Ecology, Neuglobsow, Germany, 6 měsíců, 1994
CERN, Marseille, France, 10 týdnů, 2004-2008
Researcher ID: F-9063-2014
H index: 32
| Celkem nalezeno: 117 záznamů
|
|---|
|
Vrba J., Šorf M., Nedoma J., Benedová Z., Kröpfelová L., Šulcová J., Tesařová B., Musil M., Pechar L., Potužák J., Regenda J.,
Šimek K.,
Řeháková K. (2024) Top‑down and bottom‑up control of plankton structure and dynamics in hypertrophic fishponds. Hydrobiologia
851
: 1095–1111. DOI: 10.1007/s10750-023-05312-5 |
|
Čtvrtlíková M.,
Kopáček J., Nedoma J.,
Znachor P., Hekera P.,
Vrba J. (2023) Aquatic quillworts, Isoëtes echinospora and I. lacustris under acidic stress—A review from a temperate refuge. Ecology and Evolution
13
: e9878. DOI: 10.1002/ece3.9878 |
|
Znachor P., Nedoma J., Kolář V.,
Matoušů A. (2023) Spatial and temporal variability of methane emissions and environmental conditions in a hyper-eutrophic fishpond. Biogeosciences
20
: 4273–4288. DOI: 10.5194/bg-20-4273-2023 |
|
Šimek K.,
Mukherjee I., Nedoma J.,
Pires de Paula C.,
Jezberová J.,
Sirová D.,
Vrba J. (2022) CARD-FISH and prey tracer techniques reveal the role of overlooked flagellate groups as major bacterivores in freshwater hypertrophic shallow lakes. Environmental Microbiology
24
: 4256–4273. DOI: 10.1111/1462-2920.15846 |
|
Konopáčová E., Nedoma J.,
Čapková K., Čapek P.,
Znachor P., Pouzar M.,
Říha M.,
Řeháková K. (2021) Low specific phosphorus uptake affinity of epilithon in three oligo- to mesotrophic post-mining lakes. Frontiers in Microbiology
12
: 735498. DOI: 10.3389/fmicb.2021.735498 |
|
Shabarova T.,
Salcher M.,
Porcal P.,
Znachor P., Nedoma J., Grossart H.,
Seďa J.,
Hejzlar J.,
Šimek K. (2021) Recovery of freshwater microbial communities after extreme rain events is mediated by cyclic succession. Nature Microbiology
6
: 479–488. DOI: 10.1038/s41564-020-00852-1 |
|
Čtvrtlíková M.,
Kopáček J., Nedoma J.,
Znachor P.,
Vrba J. (2020) Only the adults survive – A long-term resistance of Isoëtes lacustris to acidity and aluminium toxicity stress in a Bohemian Forest lake Ecological Indicators
111
: 106026. DOI: 10.1016/j.ecolind.2019.106026 |
|
Šimek K.,
Grujčić V.,
Mukherjee I.,
Kasalický V., Nedoma J., Posch T.,
Mehrshad M.,
Salcher M. (2020) Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes FEMS Microbiology Ecology
96
: fiaa121. DOI: doi.org/10.1093/femsec/fiaa121 |
|
Znachor P., Nedoma J.,
Hejzlar J.,
Seďa J.,
Komárková J., Kolář V.,
Mrkvička T., Boukal D.S. (2020) Changing environmental conditions underpin long-term patterns of phytoplankton in a freshwater reservoir Science of the Total Environment
710
: 135626. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2019.135626 |
|
Gabaldon Tebar C., Devetter M.,
Hejzlar J.,
Šimek K.,
Znachor P., Nedoma J.,
Seďa J. (2019) Seasonal strengths of the abiotic and biotic drivers of a zooplankton community Freshwater Biology
64
: 1326–1341. DOI: 10.1111/fwb.13308 |
|
Kolesár Fecskeová L., Piwosz K., Hanusová M., Nedoma J.,
Znachor P., Koblížek M. (2019) Diel changes and diversity of pufM expression in freshwater communities of anoxygenic phototrophic bacteria Scientific Reports
9
: 18766 . DOI: 10.1038/s41598-01 |
|
Šimek K.,
Grujčić V., Nedoma J.,
Jezberová J., Šorf M.,
Matoušů A., Pechar L., Posch T., Bruni E.P.,
Vrba J. (2019) Microbial food webs in hypertrophic fishponds: Omnivorous ciliate taxa are major protistan bacterivores Limnology and Oceanography
64
: 2295–2309. DOI: 10.1002/lno.11260 |
|
Šimek K.,
Grujčić V., Hahn M., Horňák K.,
Jezberová J.,
Kasalický V., Nedoma J.,
Salcher M.,
Shabarova T. (2018) Bacterial prey food characteristics modulate community growth response of freshwater bacterivorous flagellates Limnology and Oceanography
63
: 484–502. DOI: 10.1002/lno.10759 |
|
Vrba J., Benedová Z.,
Jezberová J.,
Matoušů A., Musil M., Nedoma J., Pechar L., Potužák J.,
Řeháková K.,
Šimek K., Šorf M., Zemanová J. (2018) Nevstoupíš dvakrát do téhož rybníka – předběžná zpráva o stavu dnešních hypertrofních rybničních ekosystémů [You cannot step into the same fishpond twice – A preliminary report on the current status of hypertrophic fishpond ecosystems] Vodní hospodářství
68 (8)
: 1-5. |
|
Vrba J., Benedová Z.,
Jezberová J.,
Matoušů A., Musil M., Nedoma J., Pechar L., Potužák J.,
Řeháková K.,
Šimek K., Šorf M., Zemanová J. (2018) Nevstoupíš dvakrát do téhož rybníka aneb vývoj rybničních ekosystémů od Šusty k hypertrofii [You cannot step into the same fishpond twice - an evolution of fishpond ecosystems to hypertrophy] Sborník konference Rybníky 2018
2-11. |
|
Vrba J., Macholdová M., Nedbalová L., Nedoma J., Šorf M. (2018) An Experimental Insight into Extracellular Phosphatases – Differential Induction of Cell-Specific Activity in Green Algae Cultured under Various Phosphorus Conditions Frontiers in Microbiology
9
: 271. DOI: 10.3389/fmicb.2018.00271 |
|
Znachor P., Nedoma J.,
Hejzlar J.,
Seďa J.,
Kopáček J., Boukal D.,
Mrkvička T. (2018) Multiple long-term trends and trend reversals dominate environmental conditions in a man-made freshwater reservoir Science of the Total Environment
624
: 24-33 . DOI: 10.1016/j.scitotenv.2017.12.061 |
|
Znachor P., Nedoma J.,
Hejzlar J.,
Seďa J.,
Kopáček J., Boukal D.,
Mrkvička T. (2018) Multiple long-term trends and trend reversals dominate environmental conditions in a man-made freshwater reservoir. Science of Total Environment
624
: 24-33. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2017.12.061 |
|
Gabaldon Tebar C., Devetter M.,
Hejzlar J.,
Šimek K.,
Znachor P., Nedoma J.,
Seďa J. (2017) Repeated flood disturbance enhances rotifer dominance and diversity in a zooplankton community of a small dammed mountain pond Journal of Limnology
76
: 292–304 . DOI: 10.4081/jlimnol.2016.1544 |
|
Jezberová J.,
Jezbera J.,
Znachor P., Nedoma J.,
Kasalický V.,
Šimek K. (2017) The Limnohabitans genus harbors generalistic and opportunistic subtypes: evidence from spatiotemporal succession in a canyon-shaped reservoir Applied and Environmental Microbiology
83
: e01530-17. DOI: 10.1128/AEM.01530-17 |
